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基于MATLAB的R方计算

基于MATLAB的R方计算

R方计算原理

什么是R方

R-square是你以后很多数据模型都需要用到的统计量,计量模型什么的,还有回归系数显著性检验,F检验,德斌沃森统计量检验。利用数据拟合一个模型时,模型肯定存在误差,那么回归方程对观测值拟合的好坏,就叫做拟合优度。这里的R方就是拟合优度的一个统计量,也可以叫做决定系数。R方计算方法为:

R2=1−∑(y−y^)2∑(y−y~)2 R^2=1- \frac{\sum(y-\hat{y})^2}{\sum(y-\widetilde{y})^2} R2=1−∑(y−y​)2∑(y−y^​)2​

式中用1减去y对回归方程的方差与y的总方差的比值,y减去y^\hat{y}y^​也就是残差,是拟合方程中不能解释的部分,用1减去不能解释的部分,那么剩下的就是解释的部分,也就是说自变量解释了因变量变动的百分比的多少,那么r方的值肯定是越大越好,意味着该模型把y的变动解释得好,R方的范围显然是0到1,在预测实践中,人们往往采纳R方最高的模型。除此之外,拟合优度还有另一个测定指标是相关系数,相关系数的公式:

r=∑i=1n(xi−x~)(yi−y~)∑i=1n(xi−x~)2∑i=1n(yi−y~)2 r=\frac{\sum_{i=1}^{n}(x_i-\widetilde{x})(y_i-\widetilde{y})}{\sqrt{\sum_{i=1}^{n}(x_i-\widetilde{x})^2\sum_{i=1}^{n}(y_i-\widetilde{y})^2}} r=∑i=1n​(xi​−x)2∑i=1n​(yi​−y​)2​∑i=1n​(xi​−x)(yi​−y​)​

从公式里面可以看出,可决系数只是相关系数的平方,它们存在的目的是为了提供互相补充的信息,它俩最著要的区别在于:相关系数有正负,正意味着因变量随自变量递增,拟合直线从左到右上升,反之意味着递减,从左到右下降。相关系数的意义不像可决系数那样明显,但也有类似的意义,与可决系数同理,它越接近于+1或者-1,拟合程度越好。

实例分析

基于MATLAB的R方计算函数(函数中有作者信息),返回R2R^2R2与RMSE

function [r2 rmse] = rsquare(y,f,varargin)

% Compute coefficient of determination of data fit model and RMSE

%

% [r2 rmse] = rsquare(y,f)

% [r2 rmse] = rsquare(y,f,c)

%

% RSQUARE computes the coefficient of determination (R-square) value from

% actual data Y and model data F. The code uses a general version of

% R-square, based on comparing the variability of the estimation errors

% with the variability of the original values. RSQUARE also outputs the

% root mean squared error (RMSE) for the user's convenience.

%

% Note: RSQUARE ignores comparisons involving NaN values.

%

% INPUTS

% Y : Actual data

% F : Model fit

%

% OPTION

% C : Constant term in model

% R-square may be a questionable measure of fit when no

% constant term is included in the model.

% [DEFAULT] TRUE : Use traditional R-square computation

% FALSE : Uses alternate R-square computation for model

% without constant term [R2 = 1 - NORM(Y-F)/NORM(Y)]

%

% OUTPUT

% R2 : Coefficient of determination

% RMSE : Root mean squared error

%

% EXAMPLE

% x = 0:0.1:10;

% y = 2.*x + 1 + randn(size(x));

% p = polyfit(x,y,1);

% f = polyval(p,x);

% [r2 rmse] = rsquare(y,f);

% figure; plot(x,y,'b-');

% hold on; plot(x,f,'r-');

% title(strcat(['R2 = ' num2str(r2) '; RMSE = ' num2str(rmse)]))

%

% Jered R Wells

% 11/17/11

% jered [dot] wells [at] duke [dot] edu

%

% v1.2 (02/14/2012)

%

% Thanks to John D'Errico for useful comments and insight which has helped

% to improve this code. His code POLYFITN was consulted in the inclusion of

% the C-option (REF. File ID: #34765).

if isempty(varargin); c = true;

elseif length(varargin)>1; error 'Too many input arguments';

elseif ~islogical(varargin{1}); error 'C must be logical (TRUE||FALSE)'

else c = varargin{1};

end

% Compare inputs

if ~all(size(y)==size(f)); error 'Y and F must be the same size'; end

% Check for NaN

tmp = ~or(isnan(y),isnan(f));

y = y(tmp);

f = f(tmp);

if c; r2 = max(0,1 - sum((y(:)-f(:)).^2)/sum((y(:)-mean(y(:))).^2));

else r2 = 1 - sum((y(:)-f(:)).^2)/sum((y(:)).^2);

if r2<0

% http://web.maths.unsw.edu.au/~adelle/Garvan/Assays/GoodnessOfFit.html

warning('Consider adding a constant term to your model') %#ok

r2 = 0;

end

end

rmse = sqrt(mean((y(:) - f(:)).^2));

调用方式

clc

clear all

close all

% 制作输入数据,y = a*x + b

x = 0:0.1:10;

y = 2.*x + 1 + randn(size(x));

p = polyfit(x,y,1)

f = polyval(p,x);

[r2 rmse] = rsquare(y,f);

figure

plot(x,y,'b.');

hold on;

plot(x,f,'r-');

axis equal

title(strcat(['R2 = ' num2str(r2) '; RMSE = ' num2str(rmse)]))

str = ['y = ' num2str(p(1)) 'x + ' num2str(p(2))];

gtext(str)

% text(mean(x),mean(y),str)

计算结果

与cftool工具箱计算结果对比

函数拟合结果相同,R2R^2R2计算结果相同,RMSE计算结果有差异。

自带计算方法

[R P] = corrcoef(x1,x2);

r = R(1,2)

引用

https://www.applysquare.com/topic-cn/SPt2Al6uO/

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